מים שנעשה בהם שימוש והיזדהמו פעם אחת או יותר עוברים מיד להגדרה של שפכים, כלומר מים משומשים, אשר אינם כשירים לשימוש נוסף, השפכים מכילים בדרך כלל מוצקים, קולואידים, מומסים וחומרים מרחפים, רק כשתי אלפיות מסך כמות השפכים הינם מוצקים מזהמים ומזיקים, ולעומת זאת 998 אלפיות הם מים בלבד,
על מנת לסלק בצורה מסודרת ובטיחותית את השפכים יש להעבירם טיפול יסודי, אשר בו מרחיקים מהמים כ – 95 אחוזים מכמות החומרים המזהמים, המים בסיומו של תהליך טיהור שפכים מכונים – קולחים.
תהליך טיהור השפכים הינו תהליך טבעי. בשפכים גולמיים אשר מגיעים לאגן טבעי או למקור מים קיים מתפתח מיד תהליך טיהור מים עצמי, המוצקים – שוקעים ומתפתחים ומתרבים בהם חיידקים אשר מפרקים את חומר הגלם האורגני, בעלי חיים מפותחים אשר חיים במקורות מים אלו – ניזונים מחיידקים אלו או מיצורי הלוואי שלהם, תהליך זה הינו אורך זמן ממושך, המלווה בהשתחררות גזים רעילים בעלי ריח רע אשר גורם למטרדים רבים,
טיפול מסודר ומבוקר הנעשה בשפכים נועד בכדי לזרז את תהליך הטיהור העצמי הנעשה בצורה טבעית, נעשה במקום בעל שטח מצומצם ומוגדר ללא יצירת מטרדים ומשלב תוך כדי הפרדה בין השפכים המטוהרים לבין השפכים הגולמיים, תוך פיקוח על שלבי פירוק והפרדת החומרים.
מערכות משולבות לטיפול וטיהור בפשכים, המנצלות את המים שעברו כבר את תהליך הטיהור להשקייה ולייצור אצות שונות כמזון בעל מרכיבים חלבוניים המיועד לבעלי חיים פותחו כבר בשנת 1978 על ידי צוות מפתחים מומחים מהטכניון בחיפה, הוגה הרעיון כולו הוא בעצם מארצות הברית בכלל. אך בפועל המערכת פותחה פה בישראל.
המערכת מורכבת מברכות מלאכותיות שטוחות אשר נבנו במיוחד למטרה זו, המחולקות לתעלות תעלות בהןמוזרמים השפכים בצורה מבוקרת באמצעות מערבלים ומושהים שם לתקופה של 2-4 ימים, בברכות אלו גידלו מראש אצות ירוקות זעירות בצפיפות ריכוזית גבוהה, בתהליך הפוטוסינתטי, אשר גורמות לפירוק החומר האורגני הנימצא בשפכים,
את השפכים המטורים ניתן להזרים לנחלים, מאגרי מים ואגמים, לאחר שמרוקנים את הברכות מהשפכים מפרידים את האצות ממי המאגר או האגם, מעבירים אותן תהליך ייבוש ומשתשים בהן כתחליף לקמח דגים וסויה.
השימוש בשפכים שעברו טיהור למטרות חקלאיות ןתעשייתיות הולך ומתרחב בארצינו בשנים האחרנות יותר ויותר.
במושבים רבים מוזרמים השפכים באמצעות רשת מסועפת ומורכבת אל מכוני הטיהור השונים.
ובעצם על ידי כך הם משתלבים בתוכניות הממשלתיות למניעת זיהום סביבתי.